种子萌发时，胚根首先突破种皮，向下生长，形成主根。

与此同时，胚轴的细胞也相应生长和伸长，把胚芽或胚芽连同子叶一起推出土面，胚芽伸出土面，形成茎和叶。

子叶随胚芽一起伸出土面，展开后转为绿色，进行光合作用，如棉花、油菜等。待胚芽的幼叶张开行使光合作用后，子叶也就枯萎脱落。至此，一株能独立生活的幼小植物体也就全部长成，这就是幼苗。

步骤一：吸水膨胀

种子浸于水中或落到潮湿的土壤中，开始时吸水较快，以后逐渐减慢。吸胀的结果使种皮变软或破裂，种皮对气体等的通透性增加，种子开始萌发。

步骤二：水合与酶的活化

种子的细胞壁和原生质发生水合，原生质从凝胶状态转变花生种子萌发过程为溶胶状态。各种酶开始活化，呼吸和代谢作用急剧增强。

步骤三：细胞分裂并增大

细胞分裂和增大时吸水量又迅速增加，胚开始生长，种子内贮存的营养物质开始大量消耗。

步骤四：胚突破种皮，长出胚芽，生成幼苗

胚突破种皮时胚生长后体积增大，突破种皮而外露。大多数种子先出胚根，接着长出胚芽，最后生成幼苗。

种子萌发的过程分为吸胀阶段、萌动阶段和发芽阶段。

1、吸胀阶段：种皮吸收水分和变软，这样有利于外界水分进去种胚。

2、萌动阶段：由于种胚细胞的分裂，细胞数目迅速增多，体积迅速变大，胚根顶破种皮而出。

3、发芽阶段：胚继续生长，胚根的生长加快，之后子叶和胚芽伸出种皮。

大多数种子先出胚根，接着长出胚芽。长成幼苗以后长出根、茎、叶，形成幼苗。有些植物如棉花、油菜、瓜类、菜豆等的种子萌发时下胚轴伸长，把子叶顶出土面，形成子叶出土幼苗。