1、花朵区别

牡丹花的花朵生于枝条顶端，多为单生，花茎较长，花型众多单瓣型、荷花型、蔷薇型等。而芍药多为丛生，花茎15厘米左右，花型少于牡丹，两者最根本的区别牡丹能长到2米高的木本植物，而芍药是不会高于1米的草本植物。

2、叶片不同

牡丹花和芍药花在叶片上可以进行区别，牡丹花的叶片较宽先端会开裂，叶色呈现正面绿色反面淡黄色，叶片下表面有白粉，而芍药花的叶片较窄先端是尖的，比牡丹更细长，叶色为黑绿色且茂密、颜色亮，有蜡质光泽。

3、花期不同

两者有着花期上的差异，牡丹花的花期比芍药花要早一些，牡丹花一般在正常环境下养护是在四月份中下旬的时候开花，而芍药花的花期在每年的5月中旬绽放，它们的花期相差了半个月左右，可以说是春开牡丹，夏开芍药。

俗称，"花中二绝″，牡丹为花王，芍药为花相的说法，牡丹略高一筹，但它们都是花中之魁首。二者也有不同之处:一，花开时间不一样。

牡丹花开比芍药花开早半个月到一个月。

二，叶的形状不一样。牡丹的叶相手掌，而芍药的叶相手指。

三，茎不一样。

牡丹是木质茎，比较粗壮，落叶之后地上部分不会枯死。芍药花茎在秋天来的时侯地上部分全部干枯掉，地下根茎没死，来年春天继续发芽生长，俗称"无骨花″。

茎不同

茎干是牡丹和芍药最明显的区别。最直接的感官差别：芍药的枝干比较柔软，但是牡丹的枝干就显得很硬实。牡丹是落叶小灌木，最高可达2米，茎干为木质，呈棕褐色；芍药是多年生草本，高不超过1米，茎干为草质，呈绿色。

牡丹是木质茎，摸上去粗糙，硬朗结实似树皮。芍药是草质茎，摸上去光滑，柔软细嫩似草茎。

牡丹的叶片先端会分裂，而芍药的叶片先端是尖的，不再分裂，牡丹的茎为木质，被称为木本，芍药的茎为草质，被人称为草本，牡丹比芍药开花早，故有谷雨三朝看牡丹，立夏三朝看芍药之说，牡丹的花色比芍药的花色要更丰富，而芍药的花色就比较少。