主要区别是，科目分类不同、生境分布不同、功效作用不同，具体如下：

一、科目分类不同

1、山茱萸

山茱萸，别名蜀枣、鬾实、鼠矢、鸡足、山萸肉，为山茱萸科植物山茱萸的干燥成熟果肉。属山茱萸目、山茱萸科、山茱萸属。

2、枸杞

枸杞，是茄科、枸杞属植物，是宁夏枸杞、中华枸杞等枸杞属物种的统称。属管状花目、茄科、茄族、枸杞属。

枸骨叶是一种常见的中药材，生长在四川省的各个地方。其中较为著名的生产区域包括雅安、乐山、遂宁、广安等地。雅安市天全县是四川省重要的枸骨叶产区之一，因该地气候条件适宜、土壤肥沃、日照充足而出产的枸骨叶品质上好，被誉为“中国枸骨叶之乡”。在中药材市场上，四川产的枸骨叶以新鲜度好、品质上佳而受到消费者的喜欢，也有很高的市场价值。

能吃，但味道很差。

枸骨，是冬青科冬青属植物。是冬青属枸骨的自然变种，常绿灌木或小乔木，树种枝繁叶茂，叶形奇特，浓绿有光泽。树冠圆整，4～5月开黄绿色小花，核果球形，初为绿色入秋成熟转红，满枝累累硕果，鲜艳夺目，经冬不凋直至来年春季，经修枝整形可制作成大树形，球形及树状盆景，是良好的观果观叶观形的观赏树种。